色譜法的分離原理是利用混合物中各組分在流動(dòng)相和固定相中具有不同的溶解-解析能力、吸附-脫附能力，或其他親和作用力的差異，當(dāng)兩相作相對(duì)運(yùn)動(dòng)時(shí)，樣品各組分在經(jīng)過固定相時(shí)發(fā)生吸附、分配、離子吸引、排阻、親和的大小、強(qiáng)弱不同，從而在固定相中滯留時(shí)間不同，這些反復(fù)多次的作用，從而使混合物各組分獲得互相分離。 在實(shí)際分析過程中，液相色譜儀流動(dòng)相與色譜柱的溫度，影響著組分的分離平衡，對(duì)于使用柱溫箱的有益之處有以下幾點(diǎn)：
1.可以使保留時(shí)間相對(duì)恒定，對(duì)需要進(jìn)行的定性鑒別可提高其可信度；
2.保留時(shí)間的重復(fù)性是色譜分析進(jìn)行定量的基礎(chǔ)，這一點(diǎn)在色譜儀檢定規(guī)程中有嚴(yán)格的要求。不同的保留時(shí)間不僅不能判斷其成份的一致性，同時(shí)，由于保留時(shí)間不同峰面積也必將發(fā)生變化，其檢測(cè)結(jié)果的可信度將受質(zhì)疑。
3.溫差較大時(shí)，因保留時(shí)間不穩(wěn)將增加檢測(cè)工作的復(fù)雜性。
4.溫度低的時(shí)候，因流動(dòng)相黏度增加而使檢測(cè)時(shí)間延長(zhǎng)，同時(shí)增加泵的磨損，影響設(shè)備的使用壽命。
5.如果溫度過低也可能出現(xiàn)堵塞高壓恒流泵、管路、進(jìn)樣閥、色譜柱的現(xiàn)象。其原因就是溫度低溶解度相對(duì)下降而出現(xiàn)緩沖鹽結(jié)晶。
6.溫度低時(shí)還因溶解度下降使雜質(zhì)吸附在填料上而難于洗脫，從而影響色譜柱的使用壽命。
